Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

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Length 421 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Dcx-204ENSMUST00000112856 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Arhgap45-203ENSMUST00000105373 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cspg4-201ENSMUST00000035661 8121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Nfia-203ENSMUST00000092532 9382 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Rrh-202ENSMUST00000171313 1759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Tia1-202ENSMUST00000095753 4477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ddo-201ENSMUST00000019977 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Zfp61-201ENSMUST00000077780 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Erbb4-202ENSMUST00000121473 12037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12397-201ENSMUST00000117674 615 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm13022-201ENSMUST00000121181 285 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm11701-201ENSMUST00000121277 1142 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm7516-201ENSMUST00000186198 706 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Atf7-201ENSMUST00000096143 390 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cdk12-201ENSMUST00000003203 4837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 2900060N12Rik-201ENSMUST00000221412 3721 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cpm-201ENSMUST00000020399 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Diexf-201ENSMUST00000085555 5570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pla1a-201ENSMUST00000002926 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Kdm2b-205ENSMUST00000121739 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pfkfb3-216ENSMUST00000191668 2216 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Pex7-201ENSMUST00000020182 8099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Dpp4-201ENSMUST00000047812 5268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Xpo7-201ENSMUST00000022696 4472 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Fignl1-207ENSMUST00000171938 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm9979-201ENSMUST00000069457 3005 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Hspd1-ps3-201ENSMUST00000119713 1722 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Adamts4-201ENSMUST00000111314 3761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ctage5-201ENSMUST00000021384 1628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Adam22-202ENSMUST00000050166 8969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Pou4f1P17208 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms