Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gulo-201ENSMUST00000059970 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Npas4-201ENSMUST00000056129 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 AC104200.1-201ENSMUST00000224527 1746 ntBASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Mthfd1-206ENSMUST00000220046 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cspp1-201ENSMUST00000071087 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Lrba-204ENSMUST00000194759 9379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Rad51d-201ENSMUST00000018985 3426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Olfr764-ps1-201ENSMUST00000204763 2854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm14164-202ENSMUST00000128577 1999 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Dis3l2-202ENSMUST00000168237 3154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm43813-201ENSMUST00000196847 2294 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mcm5-205ENSMUST00000212811 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Igf2bp2-202ENSMUST00000115379 3078 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 2700049A03Rik-203ENSMUST00000149564 5763 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cdh8-205ENSMUST00000142475 3216 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Entpd1-204ENSMUST00000134063 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Cdkn1b-202ENSMUST00000067327 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 2410002F23Rik-220ENSMUST00000191537 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm6960-201ENSMUST00000051629 639 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Ccl20O89093 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms