Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Rab36-207ENSMUST00000147802 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Lrrk1-201ENSMUST00000015277 7465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Slc5a9-201ENSMUST00000102719 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Scmh1-203ENSMUST00000106298 1995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cyp4x1-202ENSMUST00000106545 4187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pde9a-206ENSMUST00000134525 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Arid5a-202ENSMUST00000115029 4329 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gsg1-204ENSMUST00000111911 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Epb41-204ENSMUST00000105970 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pde4d-209ENSMUST00000122041 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11988-201ENSMUST00000122321 1069 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm5970-201ENSMUST00000131638 1216 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm26272-201ENSMUST00000179241 132 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm8557-201ENSMUST00000220777 475 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 BC028528-202ENSMUST00000090476 809 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Drc3-201ENSMUST00000070805 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Slc2a4rg-ps-201ENSMUST00000127559 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Hnrnpk-216ENSMUST00000177019 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Lss-201ENSMUST00000048678 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm43817-201ENSMUST00000196459 2262 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Eno2-202ENSMUST00000112476 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Dhx35-202ENSMUST00000109478 3284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tstd2-202ENSMUST00000107772 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tdp1-201ENSMUST00000021594 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 5430434F05Rik-201ENSMUST00000206080 3553 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pogk-206ENSMUST00000169324 7034 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nos1-206ENSMUST00000142742 10123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Hps4-202ENSMUST00000112359 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ssb-206ENSMUST00000166411 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Zbp1-202ENSMUST00000109116 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Atf6F6VAN0 Ubl5-203ENSMUST00000160124 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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