Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15736-201ENSMUST00000141710 420 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm4907-202ENSMUST00000163718 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps121-201ENSMUST00000176230 802 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm28490-202ENSMUST00000190946 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC167364.2-201ENSMUST00000221226 1037 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm12691-202ENSMUST00000222516 918 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Stambpl1-202ENSMUST00000119603 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 1810059H22Rik-201ENSMUST00000203249 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 AC155236.1-201ENSMUST00000220591 923 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gtpbp6Q3U6U5 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtpbp6Q3U6U5 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms