Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm30873-201ENSMUST00000207512 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm34664-202ENSMUST00000207661 1032 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC160931.1-201ENSMUST00000223298 413 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC133156.2-201ENSMUST00000226865 784 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 A430093F15Rik-201ENSMUST00000087947 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm18345-201ENSMUST00000200710 1390 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tpmt-201ENSMUST00000021806 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Fgf9-203ENSMUST00000165526 3593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC238811.2-201ENSMUST00000224554 1509 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 4930430E12Rik-201ENSMUST00000139214 901 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 1700031F10Rik-202ENSMUST00000156018 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm43802-201ENSMUST00000197826 637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Eif3k-201ENSMUST00000066070 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm25973-201ENSMUST00000083717 127 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Cd200r2-201ENSMUST00000102805 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm35618-201ENSMUST00000223164 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ccnb1ip1-201ENSMUST00000095932 1509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gprc5d-201ENSMUST00000032327 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Agmo-204ENSMUST00000160390 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ucma-202ENSMUST00000115010 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm12364-201ENSMUST00000144419 547 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Zfp978-202ENSMUST00000154154 1250 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Tmbim6-205ENSMUST00000160635 871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm8379-201ENSMUST00000165448 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm2907-201ENSMUST00000181256 1192 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm28857-201ENSMUST00000188068 425 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Wars2-205ENSMUST00000198044 403 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 AC126459.1-201ENSMUST00000214791 2123 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm4889-201ENSMUST00000075321 444 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Sorbs2-228ENSMUST00000153798 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Srsf5-203ENSMUST00000110352 1491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Srsf5-204ENSMUST00000110354 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mipol1-205ENSMUST00000145003 1424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gng12-207ENSMUST00000114228 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm12133-201ENSMUST00000121775 661 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Bcas1os2-201ENSMUST00000131931 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Mir6366-201ENSMUST00000184472 82 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm17813-201ENSMUST00000185377 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Gm46142-201ENSMUST00000213332 481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 AC139130.1-201ENSMUST00000228281 620 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rnf219-204ENSMUST00000228448 1056 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Grin2bQ01097 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.3 ms