Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cmya5-201ENSMUST00000062122 11850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cdc20b-204ENSMUST00000181568 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Vwce-201ENSMUST00000055115 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm12009-201ENSMUST00000121361 1100 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm45310-201ENSMUST00000210436 275 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 1110034G24Rik-201ENSMUST00000061891 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Brpf1-208ENSMUST00000203577 4468 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nlrx1-201ENSMUST00000034621 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gfi1b-204ENSMUST00000164290 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 4931423N10Rik-201ENSMUST00000028113 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Usp12Q9D9M2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mir1941-201ENSMUST00000157834 83 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm17231-201ENSMUST00000163186 645 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm8226-201ENSMUST00000190511 798 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC154477.1-201ENSMUST00000226515 773 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 AC137842.2-201ENSMUST00000227734 797 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ccdc30-203ENSMUST00000084307 989 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Ube2l3-201ENSMUST00000090192 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Col4a3-201ENSMUST00000113457 8554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp12Q9D9M2 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms