Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

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Length 558 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Wdr37-212ENSMUST00000176922 3780 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm37302-201ENSMUST00000192958 2998 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Vash2-202ENSMUST00000166139 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Zfyve26-201ENSMUST00000021547 9391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 AC160060.1-201ENSMUST00000217840 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 1700110I01Rik-202ENSMUST00000112812 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 CT033774.1-201ENSMUST00000223084 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Olfr1495-203ENSMUST00000216980 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Slc12a6-204ENSMUST00000110991 4556 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm23647-201ENSMUST00000175042 109 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Rn5s-201ENSMUST00000177555 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s108-201ENSMUST00000177575 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s121-201ENSMUST00000177589 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s146-201ENSMUST00000177889 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm22109-201ENSMUST00000177995 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Ccdc63Q8CDV6 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms