Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ido1-201ENSMUST00000033956 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm33940-201ENSMUST00000209205 1601 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mif-ps3-201ENSMUST00000118636 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm11225-201ENSMUST00000118903 1049 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm9458-201ENSMUST00000135273 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 9230117E06Rik-201ENSMUST00000159309 497 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm8449-201ENSMUST00000185532 988 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm36495-201ENSMUST00000221201 684 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cd2-201ENSMUST00000029456 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm19557-201ENSMUST00000182109 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Olfr452-202ENSMUST00000214465 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm13710-201ENSMUST00000126679 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm20717-201ENSMUST00000176762 657 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm33815-205ENSMUST00000195574 1204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm31363-201ENSMUST00000199362 541 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm44889-201ENSMUST00000207674 1019 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Celf2-211ENSMUST00000142941 2338 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Celf2-213ENSMUST00000150624 2332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rad54b-201ENSMUST00000070755 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 D330041H03Rik-207ENSMUST00000181760 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Sh3glb1-204ENSMUST00000199531 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm1979-201ENSMUST00000168875 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 n-R5s2-201ENSMUST00000101968 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 n-R5s194-201ENSMUST00000104719 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Prkar1a-202ENSMUST00000106676 962 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm13542-201ENSMUST00000118484 637 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm23985-201ENSMUST00000157140 124 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm26445-201ENSMUST00000177557 109 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Igkv4-62-201ENSMUST00000177795 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 n-R5s112-201ENSMUST00000178208 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 n-R5s125-201ENSMUST00000179377 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 n-R5s120-201ENSMUST00000180000 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC161374.2-201ENSMUST00000223662 596 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tmem14a-201ENSMUST00000027064 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 n-R5s33-201ENSMUST00000093713 119 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC122858.2-201ENSMUST00000228571 1362 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Kcnip4-206ENSMUST00000175660 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 AC154729.1-201ENSMUST00000224481 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Fmo4-201ENSMUST00000028014 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Nifk-201ENSMUST00000027626 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Oc90-201ENSMUST00000060522 1909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Wfdc6a-202ENSMUST00000109342 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Rcan2-203ENSMUST00000177857 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Car1-203ENSMUST00000181860 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm8079-201ENSMUST00000182695 975 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm43442-201ENSMUST00000202865 414 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Grin2bQ01097 Gm32858-201ENSMUST00000205246 585 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms