Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 5830473C10Rik-202ENSMUST00000200765 1691 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 C130083A15Rik-201ENSMUST00000205707 1460 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm12664-201ENSMUST00000118306 913 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm12583-201ENSMUST00000120677 853 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm15227-201ENSMUST00000121844 399 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm4187-201ENSMUST00000172551 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Vmn1r-ps56-201ENSMUST00000172769 965 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm4133-201ENSMUST00000172989 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm18800-202ENSMUST00000188688 1105 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm28622-201ENSMUST00000189842 507 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm42733-201ENSMUST00000201272 519 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm45240-201ENSMUST00000211437 674 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm10688-201ENSMUST00000214985 520 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC192616.3-201ENSMUST00000220797 1124 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm40598-201ENSMUST00000222953 547 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 CT010505.1-201ENSMUST00000227026 396 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Slitrk1-201ENSMUST00000100322 5359 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Mrps14-203ENSMUST00000135680 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gemin8-202ENSMUST00000087169 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Vangl1-208ENSMUST00000168312 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Pcdh20-202ENSMUST00000192557 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Olfr181-201ENSMUST00000075361 1391 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Pigp-201ENSMUST00000113905 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm16129-201ENSMUST00000152628 486 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Epb42P49222 Gm18748-201ENSMUST00000198507 622 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms