Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Nsdhl-201ENSMUST00000033715 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 AC238811.2-201ENSMUST00000224554 1509 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ripply1-201ENSMUST00000101217 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tmsb4x-203ENSMUST00000112176 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 2210408F21Rik-205ENSMUST00000138606 482 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm8813-201ENSMUST00000155930 595 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm36976-201ENSMUST00000192632 1110 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 AC137117.2-201ENSMUST00000228560 282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm3286-201ENSMUST00000171752 1316 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pax4-201ENSMUST00000031718 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Vwa3b-206ENSMUST00000169057 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ighv1-59-201ENSMUST00000103530 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm4908-201ENSMUST00000121923 1005 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 A330043C09Rik-201ENSMUST00000139823 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm23827-201ENSMUST00000157116 145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
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Chd1P40201 9230102K24Rik-201ENSMUST00000219459 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Rxfp2-202ENSMUST00000110496 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Hacl1-202ENSMUST00000127204 1699 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 L3mbtl3-203ENSMUST00000174766 3411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Gm12121-201ENSMUST00000131630 500 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Chd1P40201 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chd1P40201 Pcdhb20-201ENSMUST00000052179 3559 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
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Chd1P40201 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
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Chd1P40201 Dtwd1-202ENSMUST00000170908 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 1700120C14Rik-201ENSMUST00000187706 326 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 9030619P08Rik-202ENSMUST00000190141 435 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Chd1P40201 Abhd3-201ENSMUST00000002549 1885 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Chd1P40201 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Chd1P40201 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chd1P40201 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC15.08■□□□□ 0
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