Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Celf1-208ENSMUST00000111455 7579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Irf4-202ENSMUST00000110307 4761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Irf4-201ENSMUST00000021784 4764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Polh-201ENSMUST00000024749 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm1000-202ENSMUST00000222329 757 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Amer3-201ENSMUST00000052670 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Pld1-201ENSMUST00000067757 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm43307-201ENSMUST00000199465 2371 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Etv1-204ENSMUST00000160701 1578 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Phc1-211ENSMUST00000161054 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Chd2-203ENSMUST00000169922 9085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 4930578C19Rik-201ENSMUST00000044188 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Mut-201ENSMUST00000169611 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm42450-201ENSMUST00000199286 2644 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Plekha6-201ENSMUST00000038295 7388 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm15554-201ENSMUST00000120406 913 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm25394-201ENSMUST00000157338 133 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm25343-201ENSMUST00000157460 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm27953-201ENSMUST00000185171 143 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm35584-201ENSMUST00000191767 641 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Gm43866-201ENSMUST00000203894 839 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 2310039L15Rik-203ENSMUST00000220058 727 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 CT025645.2-201ENSMUST00000223278 3827 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Psmb7-201ENSMUST00000028083 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Specc1-208ENSMUST00000201624 2518 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Taf4E9QAP7 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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