Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Acot11-202ENSMUST00000102762 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm45330-201ENSMUST00000209681 1575 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Kir3dl2-201ENSMUST00000072125 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hp1bp3-214ENSMUST00000165861 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Esrp2-201ENSMUST00000115979 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 4930556L07Rik-201ENSMUST00000134422 1490 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm44189-201ENSMUST00000204387 3083 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm14372-201ENSMUST00000125355 2193 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 D030018L15Rik-202ENSMUST00000139808 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Zfp423-203ENSMUST00000165770 4334 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Acmsd-201ENSMUST00000038006 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Lims1-201ENSMUST00000020077 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Miga2-202ENSMUST00000100214 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm20455-201ENSMUST00000174100 1138 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm6773-201ENSMUST00000182377 878 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm5274-201ENSMUST00000182641 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nosip-207ENSMUST00000210520 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC134439.3-201ENSMUST00000223486 851 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC107711.1-201ENSMUST00000227258 1295 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm17644-201ENSMUST00000181272 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nfrkb-201ENSMUST00000086167 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Reep1-203ENSMUST00000212792 3339 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Enox2-202ENSMUST00000114911 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm38111-201ENSMUST00000194817 2741 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC165080.1-201ENSMUST00000215257 3123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nrf1-203ENSMUST00000069831 1625 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Arhgef9-204ENSMUST00000113882 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms