Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Nmbr-207ENSMUST00000190751 921 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Olfr709-ps1-201ENSMUST00000072368 924 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Scnn1a-201ENSMUST00000081440 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Wdr78-201ENSMUST00000036451 3671 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ptpn7-201ENSMUST00000049449 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tns1-201ENSMUST00000169786 9966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Zfp386-201ENSMUST00000073551 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm21039-201ENSMUST00000223359 2012 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Odf2-205ENSMUST00000113757 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Klhl22-202ENSMUST00000120488 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Greb1-201ENSMUST00000048064 7940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 9530026P05Rik-201ENSMUST00000181121 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tacr1-202ENSMUST00000203775 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Erc2-201ENSMUST00000090302 6083 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Itga10-202ENSMUST00000119365 5035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Itgal-203ENSMUST00000118405 3909 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Parp3-201ENSMUST00000067218 2962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm15602-201ENSMUST00000116162 465 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 1700026J14Rik-201ENSMUST00000180937 794 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tmem63a-205ENSMUST00000161523 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Bcor-201ENSMUST00000043441 6113 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Rpl18-207ENSMUST00000210640 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Htr1a-201ENSMUST00000022235 4484 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 AC110091.2-201ENSMUST00000215107 1512 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pdcl-202ENSMUST00000112940 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Npnt-205ENSMUST00000117456 3383 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Pcdh18-202ENSMUST00000191794 5146 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Ispd-206ENSMUST00000223068 2808 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Plbd1-201ENSMUST00000032336 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 4930478P22Rik-203ENSMUST00000202026 2060 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Stx16-201ENSMUST00000044638 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm13938-201ENSMUST00000156809 493 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SbdsP70122 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
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