Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmod1P49813 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ppp2r2a-201ENSMUST00000089230 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Lin54-209ENSMUST00000152387 2760 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Khdrbs2-204ENSMUST00000188257 5278 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Toe1-201ENSMUST00000030451 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm4943-201ENSMUST00000132879 424 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tmem229b-ps-201ENSMUST00000168554 506 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm18122-201ENSMUST00000211390 904 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC100406.1-201ENSMUST00000217305 480 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Psmd12-202ENSMUST00000106750 1311 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Fam90a1b-201ENSMUST00000044989 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 A1bg-201ENSMUST00000096418 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Plrg1-204ENSMUST00000150268 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm44888-201ENSMUST00000209119 2541 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Anapc15-213ENSMUST00000178851 2797 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm8216-201ENSMUST00000117232 601 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm16048-201ENSMUST00000134250 663 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Fkbp6-202ENSMUST00000201534 1287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC134860.5-201ENSMUST00000225071 1249 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Kcng4-201ENSMUST00000061828 3806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Klk1b22-201ENSMUST00000077528 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gstm4-203ENSMUST00000178808 1462 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tpd52-202ENSMUST00000091354 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Tmod1P49813 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.2 ms