Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Acp1-202ENSMUST00000074038 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm26724-201ENSMUST00000180434 1650 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ptgs2os2-201ENSMUST00000181308 1745 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gtpbp10-202ENSMUST00000115441 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Tal2-201ENSMUST00000030124 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Oas3-201ENSMUST00000044833 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Slc27a5-201ENSMUST00000032539 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm19611-201ENSMUST00000216401 1865 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Fam187b-201ENSMUST00000058093 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Ttc16-206ENSMUST00000161430 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Il1r1-201ENSMUST00000027241 5819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Dnajb13-204ENSMUST00000207405 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Il9r-205ENSMUST00000145401 4482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Padi3-201ENSMUST00000026377 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Birc6-202ENSMUST00000180037 15768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm10603-201ENSMUST00000183512 2279 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
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Ccl20O89093 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Zfp54-201ENSMUST00000007884 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Zfp133-ps-201ENSMUST00000119058 1802 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Usp4-209ENSMUST00000194959 3436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Riok3-201ENSMUST00000025270 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cd22-213ENSMUST00000190617 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Plod1-201ENSMUST00000019199 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm10804-201ENSMUST00000099693 2244 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm45728-201ENSMUST00000211475 2979 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Sec31b-201ENSMUST00000063632 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Dpf2-205ENSMUST00000136983 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
Ccl20O89093 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
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