Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Sfi1-203ENSMUST00000101655 3888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pantr1-208ENSMUST00000181660 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slc5a4a-201ENSMUST00000020450 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 1700030K09Rik-201ENSMUST00000064853 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cpvl-201ENSMUST00000166545 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc14-201ENSMUST00000026410 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Micall2-204ENSMUST00000170773 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Myt1l-205ENSMUST00000218583 4522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slc17a2-202ENSMUST00000099697 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 2310043P16Rik-201ENSMUST00000205403 3881 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pfkm-201ENSMUST00000051226 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Olfr366-202ENSMUST00000214897 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Acot12-201ENSMUST00000022120 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AU018091-201ENSMUST00000171749 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mfap3l-201ENSMUST00000034066 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 2810471M01Rik-201ENSMUST00000146554 1597 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Htr5a-201ENSMUST00000036227 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Dcun1d4-201ENSMUST00000063882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Igkv4-54-201ENSMUST00000177697 288 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Inpp4a-205ENSMUST00000132401 3234 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rbm10-204ENSMUST00000115374 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp541-201ENSMUST00000108509 4561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Babam2-202ENSMUST00000071531 1308 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Sypl-202ENSMUST00000076698 4999 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Uhrf1-204ENSMUST00000113039 3391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp111-201ENSMUST00000056683 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Zfp58-201ENSMUST00000076123 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cr1l-204ENSMUST00000193094 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Inpp5d-201ENSMUST00000042275 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Spry4-201ENSMUST00000025295 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC133934.1-201ENSMUST00000223052 1761 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 AC123731.1-201ENSMUST00000227417 1403 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Pde1c-204ENSMUST00000164752 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fadd-201ENSMUST00000033394 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm20735-201ENSMUST00000212077 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Grik1-211ENSMUST00000228188 3221 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm45139-201ENSMUST00000206543 2057 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Atg9a-201ENSMUST00000040689 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fam210a-201ENSMUST00000042852 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Smgc-204ENSMUST00000109277 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fam3a-204ENSMUST00000114141 1243 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 1700001J04Rik-202ENSMUST00000154037 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Atg16l1Q8C0J2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
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