Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Aif1l-207ENSMUST00000148056 670 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm3912-202ENSMUST00000210164 643 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Prrg3-201ENSMUST00000048790 5931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45757-201ENSMUST00000211835 1480 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gabrr3-201ENSMUST00000114341 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Frmpd3-203ENSMUST00000208130 7314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44815-201ENSMUST00000206812 1633 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slc25a14-204ENSMUST00000134257 1805 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gpr35-202ENSMUST00000064480 3409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rab27a-201ENSMUST00000034722 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slc17a3-203ENSMUST00000110422 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dhrs7b-201ENSMUST00000042281 1553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Phka2-204ENSMUST00000112380 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ehmt1-202ENSMUST00000091348 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Itga9-202ENSMUST00000124360 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Acsl5-201ENSMUST00000043150 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Sfi1-218ENSMUST00000153425 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cux1-211ENSMUST00000176745 2831 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Nadsyn1-201ENSMUST00000033415 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cdkl1-201ENSMUST00000021377 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tnxa-201ENSMUST00000173277 2975 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ddr1-203ENSMUST00000117301 3874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dhcr7-202ENSMUST00000124340 2556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm16574-201ENSMUST00000159301 745 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm16581-201ENSMUST00000160730 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC160991.1-201ENSMUST00000224924 753 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Slco5a1-206ENSMUST00000147606 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 C330021F23Rik-202ENSMUST00000136592 1621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Exosc1-201ENSMUST00000075280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Itsn1-204ENSMUST00000113993 3787 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 9130019O22Rik-201ENSMUST00000049052 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Bcl2l14-202ENSMUST00000111960 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Olfr1219-203ENSMUST00000214442 3694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Actn2-203ENSMUST00000168193 2920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Dubr-202ENSMUST00000186535 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 AC123534.1-202ENSMUST00000224256 1837 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Q8BGC1 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms