Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tmem131l-203ENSMUST00000192095 4774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ptma-201ENSMUST00000045897 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rpl3-201ENSMUST00000081650 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1219-201ENSMUST00000099797 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Map2-206ENSMUST00000114017 4981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lep-201ENSMUST00000069789 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Chrm5-201ENSMUST00000099589 1599 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Spaca9-201ENSMUST00000102877 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Prl8a2-202ENSMUST00000110363 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mapk8-202ENSMUST00000111942 927 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fam240b-201ENSMUST00000180282 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm4032-203ENSMUST00000211600 531 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm18596-201ENSMUST00000218133 843 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm8796-201ENSMUST00000219122 936 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Calm4-201ENSMUST00000042219 917 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Stxbp5l-206ENSMUST00000114787 4394 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Hmgcr-201ENSMUST00000022176 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 4933422A05Rik-201ENSMUST00000213706 1356 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Dsg1bQ7TSF1 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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