Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Mef2a-204ENSMUST00000107476 4759 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tbc1d31-201ENSMUST00000022992 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm37798-201ENSMUST00000193026 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm45397-201ENSMUST00000209816 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gmip-201ENSMUST00000036074 3933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm13497-201ENSMUST00000139497 2038 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm40289-201ENSMUST00000201470 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Eif4e1b-201ENSMUST00000110003 2131 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Grin2a-201ENSMUST00000032331 4395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sh3tc1-207ENSMUST00000201511 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sppl2c-202ENSMUST00000107000 2225 ntAPPRIS P4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sppl2c-201ENSMUST00000059448 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Pear1-202ENSMUST00000079083 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm44304-201ENSMUST00000200509 145 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Adig-201ENSMUST00000059889 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm7052-201ENSMUST00000167568 1512 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Slco5a1-205ENSMUST00000146763 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Manba-201ENSMUST00000029814 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ints2-201ENSMUST00000018212 5906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rint1-203ENSMUST00000115113 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm4810-201ENSMUST00000177721 1607 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mid1-202ENSMUST00000078947 3591 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Padi1-201ENSMUST00000026378 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cptp-201ENSMUST00000030950 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Fam53b-206ENSMUST00000106168 3630 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm43820-201ENSMUST00000199414 3346 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Atp6v0e2-201ENSMUST00000040361 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Immt-206ENSMUST00000166975 2469 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cenpl-201ENSMUST00000028035 4883 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ccr6-204ENSMUST00000167956 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AC124581.2-201ENSMUST00000225459 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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