Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Cngb1-204ENSMUST00000121162 3336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nipal3-202ENSMUST00000105856 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Rps9-203ENSMUST00000108624 478 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gpm6b-204ENSMUST00000112226 3174 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ank1-205ENSMUST00000117296 6794 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 St6galnac2-206ENSMUST00000144398 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15612-201ENSMUST00000147542 3118 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12927-201ENSMUST00000150252 373 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15641-201ENSMUST00000161407 670 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tle3-217ENSMUST00000162973 4114 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 E2f7-204ENSMUST00000173471 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gtf2i-223ENSMUST00000174513 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm25953-201ENSMUST00000175338 83 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Apba2-206ENSMUST00000206246 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Lrrc28-202ENSMUST00000053950 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tbata-202ENSMUST00000079235 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Camk2g-202ENSMUST00000080440 3604 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mfsd2b-204ENSMUST00000137337 2641 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Catsperd-201ENSMUST00000112979 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Wdr25-201ENSMUST00000047115 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Strip2-202ENSMUST00000115224 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm13128-201ENSMUST00000105751 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm44699-201ENSMUST00000208229 5083 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Pdpr-201ENSMUST00000039333 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Bsn-201ENSMUST00000035208 15938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm7598-201ENSMUST00000130251 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Spata13-201ENSMUST00000022566 7517 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Nuggc-201ENSMUST00000079469 2567 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm16234-201ENSMUST00000124976 815 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm15911-201ENSMUST00000138992 809 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm12737-201ENSMUST00000142835 725 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Olfr1513-201ENSMUST00000089739 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Stk26-201ENSMUST00000033444 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
H2-Eb1P04230 Myo1c-202ENSMUST00000102504 4659 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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