Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Dsg1a-201ENSMUST00000077146 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Siglech-203ENSMUST00000121492 1655 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Scfd2-208ENSMUST00000151474 3834 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Pdgfd-202ENSMUST00000168039 1795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ncapg2-201ENSMUST00000084828 4684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm10608-201ENSMUST00000093527 2509 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm16630-201ENSMUST00000180741 3257 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Inpp4b-212ENSMUST00000215332 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 4930571K23Rik-201ENSMUST00000166958 2153 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Spata17-201ENSMUST00000027908 1303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Xdh-201ENSMUST00000024866 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Zfx-203ENSMUST00000113926 6762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gpatch2l-201ENSMUST00000071106 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Dqx1-201ENSMUST00000077502 3257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Styk1-201ENSMUST00000049150 3380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Atp4a-201ENSMUST00000005692 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm26782-201ENSMUST00000181482 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Sipa1l1-210ENSMUST00000222714 6002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ercc3-201ENSMUST00000025241 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Kif28-201ENSMUST00000131716 3526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Kif28-203ENSMUST00000221136 3538 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Atp9a-202ENSMUST00000109175 3729 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm37141-201ENSMUST00000191938 422 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm6069-201ENSMUST00000196501 463 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm8634-201ENSMUST00000222547 1367 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Cbr4-201ENSMUST00000034058 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gpatch2-202ENSMUST00000065573 4547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Cd300a-202ENSMUST00000106582 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm37125-201ENSMUST00000195877 1559 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Eif4e1b-206ENSMUST00000132728 1897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Rap1gds1-201ENSMUST00000029796 3383 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Bcl9-207ENSMUST00000166341 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ctsl-205ENSMUST00000222517 6168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ubox5-201ENSMUST00000028761 3731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Aldh18a1-201ENSMUST00000025979 3527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm35725-201ENSMUST00000221862 2800 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Firre-206ENSMUST00000203933 5555 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm36752-201ENSMUST00000220527 1546 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm9860-201ENSMUST00000211426 3653 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Pvt1-203ENSMUST00000181657 2798 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm15666-202ENSMUST00000219490 2796 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Fbxw11-202ENSMUST00000093205 3938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Limk2-202ENSMUST00000101640 3711 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 4930570G19Rik-201ENSMUST00000139363 3112 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Zfp131-203ENSMUST00000223722 3109 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Crx-201ENSMUST00000044434 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ankrd6-205ENSMUST00000108166 2321 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Actl9-201ENSMUST00000174088 1373 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Adgrl3-204ENSMUST00000117407 5705 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Rps19-ps3-201ENSMUST00000116174 426 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm8625-201ENSMUST00000194185 1077 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -1
Derl3Q9D8K3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC8.79□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms