Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Gm12592-201ENSMUST00000155332 2954 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Gm35657-201ENSMUST00000215869 989 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 AC149294.3-201ENSMUST00000226888 732 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Rufy4-201ENSMUST00000080167 2306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Col10a1-201ENSMUST00000105511 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Zfp114-201ENSMUST00000086010 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Rabl3Q9D4V7 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Pfkm-202ENSMUST00000163507 2816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Stx8-201ENSMUST00000021285 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Ano4-204ENSMUST00000182341 3959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Tnk2-206ENSMUST00000115125 4313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Asxl2-207ENSMUST00000153102 4462 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Atg14-201ENSMUST00000042988 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm15535-202ENSMUST00000148478 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm26772-201ENSMUST00000180466 3429 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm20953-201ENSMUST00000216399 2614 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Nedd4l-211ENSMUST00000226058 3393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Plcd4-201ENSMUST00000027362 2977 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Itgb6-201ENSMUST00000028348 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gas7-202ENSMUST00000108680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm42460-201ENSMUST00000198863 2567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Rnasek-203ENSMUST00000141880 465 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm29179-208ENSMUST00000190450 1137 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm45758-201ENSMUST00000212448 1006 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 2010001K21Rik-201ENSMUST00000060680 519 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Rnf111-202ENSMUST00000113595 4735 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Rnf111-207ENSMUST00000215848 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Eif2d-203ENSMUST00000112446 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Fam110c-201ENSMUST00000041133 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Polr3f-202ENSMUST00000110017 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Cdca8-202ENSMUST00000084296 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Grb2-204ENSMUST00000106499 2333 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 CK137956-201ENSMUST00000030614 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Pla2g5-201ENSMUST00000030524 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Slc27a6-201ENSMUST00000025500 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 D630003M21Rik-203ENSMUST00000169335 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Oacyl-202ENSMUST00000117694 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Sms-201ENSMUST00000112529 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Mfn2-201ENSMUST00000030884 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Inpp4a-207ENSMUST00000136846 3576 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Myc-204ENSMUST00000160009 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm36426-201ENSMUST00000222903 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Itga9-202ENSMUST00000124360 1935 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Dntt-202ENSMUST00000112200 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm20186-201ENSMUST00000201775 737 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Rabl3Q9D4V7 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms