Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0S4

Ttc21a, Tetratricopeptide repeat protein 21A, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21aQ8C0S4 Nlrc5-202ENSMUST00000098489 1721 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Plscr4-201ENSMUST00000034941 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 0610040B10Rik-202ENSMUST00000162890 600 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm6342-201ENSMUST00000204344 766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Xlr4b-201ENSMUST00000069077 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Mdm1-203ENSMUST00000164077 2922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm44907-201ENSMUST00000207423 1633 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Vil1-201ENSMUST00000027366 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Zc3h7a-201ENSMUST00000037633 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Atp5s-201ENSMUST00000021372 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Acsl1-201ENSMUST00000034046 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Arg2-201ENSMUST00000021550 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Micalcl-202ENSMUST00000051308 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Thap2-201ENSMUST00000020346 3681 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Zfp418-201ENSMUST00000051435 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Gm43412-201ENSMUST00000197455 2818 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ttc21aQ8C0S4 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 CT025639.2-202ENSMUST00000225298 1630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm14239-201ENSMUST00000116491 685 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm1758-201ENSMUST00000164528 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm24368-201ENSMUST00000175388 106 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 AC165092.1-201ENSMUST00000224018 486 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Tnfrsf18-201ENSMUST00000040274 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 4932702P03Rik-202ENSMUST00000151220 2792 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm39312-201ENSMUST00000213586 2195 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 B4galt4-204ENSMUST00000114711 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Kcne1-201ENSMUST00000051705 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Srpk1-204ENSMUST00000130643 4465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Chad-201ENSMUST00000040418 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Cyp2d9-201ENSMUST00000089129 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Adra1a-205ENSMUST00000161339 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gemin8-201ENSMUST00000056410 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Zdhhc9-201ENSMUST00000037960 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 5430430B14Rik-201ENSMUST00000209427 1630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm44570-201ENSMUST00000207526 3698 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Aoc1-201ENSMUST00000031835 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm12847-201ENSMUST00000156219 413 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc21aQ8C0S4 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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