Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 9130221F21Rik-201ENSMUST00000206867 2631 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44095-201ENSMUST00000204631 1931 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Igkv3-9-201ENSMUST00000103398 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm26119-201ENSMUST00000175601 104 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm37232-201ENSMUST00000194887 367 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm7082-201ENSMUST00000209880 969 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm45363-201ENSMUST00000210196 1294 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Arhgap12-201ENSMUST00000062584 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mia3-202ENSMUST00000109158 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Inpp5b-201ENSMUST00000094782 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Epn2-203ENSMUST00000108712 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mdga2-212ENSMUST00000222987 1388 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm42735-201ENSMUST00000201718 1646 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm44629-201ENSMUST00000206951 1840 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm15041-201ENSMUST00000119048 756 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm5266-201ENSMUST00000187302 1162 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 1700047G03Rik-205ENSMUST00000227822 1048 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lrsam1-202ENSMUST00000113200 4030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Sgca-201ENSMUST00000100551 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm26668-201ENSMUST00000181125 3635 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Sftpa1-202ENSMUST00000170719 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm6783-201ENSMUST00000120916 1437 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Vps33a-201ENSMUST00000031388 4235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Acsm2-201ENSMUST00000084647 2051 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fubp1-201ENSMUST00000106121 4525 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Nox1-204ENSMUST00000159259 1581 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Tmem156-201ENSMUST00000043352 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Spaca3-201ENSMUST00000103222 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Q8BGC1 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms