Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm16211-201ENSMUST00000147722 1620 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Cidec-203ENSMUST00000113091 785 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm12874-201ENSMUST00000117190 913 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm26851-201ENSMUST00000181867 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Prl8a6-201ENSMUST00000018392 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm5340-201ENSMUST00000203733 880 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm45800-201ENSMUST00000210331 700 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Flt3l-210ENSMUST00000211246 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Olfr860-203ENSMUST00000212353 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm9204-201ENSMUST00000212641 947 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm36173-201ENSMUST00000219101 1163 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Olfr799-201ENSMUST00000071126 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm25475-201ENSMUST00000082825 180 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Zfp120-202ENSMUST00000094538 1245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Olfr1241-201ENSMUST00000099778 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm19967-201ENSMUST00000179676 2138 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm44436-201ENSMUST00000204200 1494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Trbv2-201ENSMUST00000103263 560 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Dnhd1-201ENSMUST00000106776 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm11945-201ENSMUST00000120551 476 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Aamdc-209ENSMUST00000144858 380 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smpd1Q04519 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.3 ms