Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Gm21188-201ENSMUST00000178618 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm28922-201ENSMUST00000189785 308 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 AC162893.1-201ENSMUST00000207732 1085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm38941-201ENSMUST00000208606 529 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm32710-201ENSMUST00000210677 618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ctsw-201ENSMUST00000025844 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Catspere1-201ENSMUST00000194528 2949 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Cyp2g1-201ENSMUST00000040944 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Sav1-201ENSMUST00000021467 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm18901-201ENSMUST00000197840 1444 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Hdac9-203ENSMUST00000209667 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 4921508D12Rik-201ENSMUST00000124095 1075 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Zfp422-ps-201ENSMUST00000182230 706 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm9621-201ENSMUST00000183322 1003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm28676-201ENSMUST00000188990 591 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Spata45-202ENSMUST00000192151 443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm38320-201ENSMUST00000192767 1281 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm42620-201ENSMUST00000197715 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 4930448C13Rik-205ENSMUST00000221781 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm18030-201ENSMUST00000222163 731 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 9330161L09Rik-201ENSMUST00000056140 999 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gpcpd1-201ENSMUST00000028822 3179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Sept11-207ENSMUST00000202217 1380 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Grin2bQ01097 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm8446-201ENSMUST00000188834 2712 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Blnk-201ENSMUST00000054769 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Pm20d1-201ENSMUST00000048660 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmem74bos-202ENSMUST00000149319 2090 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm15894-201ENSMUST00000162828 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm11100-201ENSMUST00000112652 1951 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mageb2-201ENSMUST00000101397 1143 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm12645-201ENSMUST00000117297 275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm13864-201ENSMUST00000119745 785 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Zfp740-205ENSMUST00000121206 795 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Cfap77-202ENSMUST00000157048 1042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm26619-201ENSMUST00000180396 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 3300005D01Rik-204ENSMUST00000181484 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mageb1-201ENSMUST00000072269 1143 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mir195a-201ENSMUST00000083477 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Rpl7a-ps8-201ENSMUST00000094754 801 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mageb1-202ENSMUST00000099471 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Lnpk-201ENSMUST00000064503 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Arhgap4-202ENSMUST00000114404 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mospd1-201ENSMUST00000023836 1763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Mospd1-202ENSMUST00000096447 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Odam-201ENSMUST00000113274 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm6880-201ENSMUST00000114125 627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm15363-201ENSMUST00000118897 631 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ak3l2-ps-201ENSMUST00000120282 672 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm14407-201ENSMUST00000121260 447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm14983-201ENSMUST00000121551 323 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Snhg17-208ENSMUST00000154242 346 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Ggta1-209ENSMUST00000164889 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 2010110E17Rik-201ENSMUST00000184161 879 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 Gm29266-201ENSMUST00000190392 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Grin2bQ01097 4931431B13Rik-202ENSMUST00000205646 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms