Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 AC153512.3-201ENSMUST00000220426 662 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC157650.1-201ENSMUST00000224582 610 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC137950.2-201ENSMUST00000227127 1089 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm37583-201ENSMUST00000195460 2487 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ufsp2-201ENSMUST00000034051 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Unc5cl-201ENSMUST00000074574 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Krba1-208ENSMUST00000203371 4000 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Enah-211ENSMUST00000193703 11229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Adar-205ENSMUST00000121094 2321 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tcf20-202ENSMUST00000109510 7347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sbno2-201ENSMUST00000042771 4227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gria1-202ENSMUST00000094179 5399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Trib2-201ENSMUST00000020922 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Pde10a-211ENSMUST00000149440 4897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nudcd3-201ENSMUST00000066496 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gabrb3-206ENSMUST00000196198 4348 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Actn2-201ENSMUST00000064204 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm13120-201ENSMUST00000117343 1446 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Htr3b-201ENSMUST00000008734 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Hecw2-201ENSMUST00000087659 11171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm11475-201ENSMUST00000118482 476 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 4930471C04Rik-201ENSMUST00000166038 865 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Glmp-207ENSMUST00000176425 960 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm44511-201ENSMUST00000204394 678 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm44511-202ENSMUST00000204423 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm5189-201ENSMUST00000221796 261 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm27177-201ENSMUST00000183339 2946 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sap130-202ENSMUST00000178164 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nrp2-205ENSMUST00000114155 6534 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Zbtb34-201ENSMUST00000091037 6510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Supt7l-205ENSMUST00000202421 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Loxl3-202ENSMUST00000101257 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Zfp948-201ENSMUST00000088787 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Arnt2-207ENSMUST00000208232 6047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ttc39b-203ENSMUST00000102823 8831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Lrrc23-202ENSMUST00000112475 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms