Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Hdac9-208ENSMUST00000211107 1683 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm11619-201ENSMUST00000117474 237 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 D430040D24Rik-201ENSMUST00000149224 910 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm24352-201ENSMUST00000158966 125 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm9146-201ENSMUST00000182254 1006 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 1700019D03Rik-206ENSMUST00000190831 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37350-201ENSMUST00000192782 313 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37452-201ENSMUST00000194416 1160 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nosip-207ENSMUST00000210520 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dpysl2-201ENSMUST00000022629 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Trim13-202ENSMUST00000165015 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ank1-206ENSMUST00000117662 6257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Wdr95-207ENSMUST00000202902 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm5310-201ENSMUST00000197861 1511 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cfap100-201ENSMUST00000062750 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lrba-201ENSMUST00000107635 9888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37975-201ENSMUST00000195494 2099 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Olfr73-202ENSMUST00000129056 3048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Etnppl-203ENSMUST00000166187 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tial1-202ENSMUST00000106226 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Trpm5-201ENSMUST00000009390 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm13920-201ENSMUST00000146134 1663 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pla2g5-203ENSMUST00000102512 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ap1m2-202ENSMUST00000115433 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rabep1-206ENSMUST00000177731 3167 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Mon2-201ENSMUST00000037557 5511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Plscr2-205ENSMUST00000180154 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Hcar2-201ENSMUST00000057145 1930 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Greb1l-201ENSMUST00000048977 8414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 P2rx7-201ENSMUST00000031425 1605 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Kdm4a-203ENSMUST00000106403 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tmem67-202ENSMUST00000108293 3945 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pcdh15-221ENSMUST00000146682 1891 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Psme2-201ENSMUST00000111378 795 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms