Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

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Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Tnfsf18-201ENSMUST00000086084 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm37084-201ENSMUST00000191688 5898 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Morf4l2-213ENSMUST00000166478 1720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Zfp275-201ENSMUST00000033731 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ggcx-201ENSMUST00000065906 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ankrd36-201ENSMUST00000109855 1363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4833420G17Rik-201ENSMUST00000026519 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Hdac7-208ENSMUST00000121514 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cage1-203ENSMUST00000110233 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Slc28a1-202ENSMUST00000119083 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Specc1-214ENSMUST00000202389 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Nlgn3-206ENSMUST00000151528 8541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Astn1-201ENSMUST00000046110 7195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm16429-202ENSMUST00000201400 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm7971-201ENSMUST00000086950 1848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm43288-201ENSMUST00000197594 2628 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Add2-210ENSMUST00000205034 3266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Fam217a-202ENSMUST00000223834 2253 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Itgam-207ENSMUST00000098015 4803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm24248-201ENSMUST00000157321 322 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Has2os-202ENSMUST00000163314 633 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 CT030011.1-201ENSMUST00000221959 264 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Kif14-201ENSMUST00000047817 8770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Myo18a-203ENSMUST00000092887 7304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Enpp7-201ENSMUST00000092373 1370 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Cpt1b-201ENSMUST00000109313 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm19409-201ENSMUST00000198244 2858 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Mroh3-205ENSMUST00000212798 2933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Vmn1r199-203ENSMUST00000227689 5537 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm21817-201ENSMUST00000178584 2583 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm25830-201ENSMUST00000158923 132 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm5881-201ENSMUST00000204737 367 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Sp3-201ENSMUST00000066003 3808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ClgnP52194 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms