Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 AC160991.2-201ENSMUST00000223784 1135 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 AC154848.1-201ENSMUST00000225451 846 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Akr1cl-206ENSMUST00000162800 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 H2-Ob-201ENSMUST00000095342 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm3712-201ENSMUST00000118523 2071 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cinp-202ENSMUST00000220607 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Stoml3-201ENSMUST00000029307 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm36990-201ENSMUST00000191961 1412 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Clrn2-201ENSMUST00000053250 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm9430-201ENSMUST00000121232 1527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Olfr10-201ENSMUST00000187570 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Olfr1392-201ENSMUST00000189851 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 AC119987.1-201ENSMUST00000212316 848 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 AC090962.1-201ENSMUST00000226066 1799 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm44933-201ENSMUST00000208637 1987 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Samd13-204ENSMUST00000147113 729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Chd1P40201 Aamdc-214ENSMUST00000178078 723 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm10229-201ENSMUST00000089106 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Olfr237-ps1-201ENSMUST00000095953 1000 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm43593-201ENSMUST00000198605 1346 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm13655-201ENSMUST00000119695 745 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 3110056K07Rik-201ENSMUST00000127129 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm23027-201ENSMUST00000158771 158 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm25082-201ENSMUST00000177296 255 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Rpf2-206ENSMUST00000183309 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm8976-201ENSMUST00000187136 703 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Gm29718-201ENSMUST00000193396 477 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 AC140264.1-201ENSMUST00000220023 469 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Chd1P40201 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms