Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Hspa12b-202ENSMUST00000100763 628 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm12225-201ENSMUST00000117995 298 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm18859-201ENSMUST00000118792 825 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm16458-201ENSMUST00000121428 502 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps64-201ENSMUST00000173690 523 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm19560-201ENSMUST00000177510 514 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm7456-201ENSMUST00000182862 1011 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm28881-201ENSMUST00000187710 470 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm7967-203ENSMUST00000191409 1049 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm42625-201ENSMUST00000198611 922 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm43851-201ENSMUST00000200726 327 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Clec2g-205ENSMUST00000203405 967 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm6064-201ENSMUST00000203999 454 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm44673-201ENSMUST00000205692 996 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm40638-201ENSMUST00000216422 682 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 2210039B01Rik-201ENSMUST00000222490 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC124484.1-201ENSMUST00000223212 652 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC163038.2-201ENSMUST00000224851 650 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC163351.1-201ENSMUST00000225539 737 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC102815.1-201ENSMUST00000226662 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pudp-201ENSMUST00000056460 1044 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
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Hoxb4P10284 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm14415-201ENSMUST00000118260 1578 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Tfpi-201ENSMUST00000028487 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Hoxb4P10284 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
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