Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Nupl1-202ENSMUST00000041905 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Eea1-201ENSMUST00000053484 7749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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Ccl20O89093 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
Ccl20O89093 Mir6360-201ENSMUST00000184278 126 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
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