Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tmem208-202ENSMUST00000098453 950 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Fhad1-203ENSMUST00000105780 4809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Prrc1-201ENSMUST00000025490 4801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Celf2-224ENSMUST00000182879 2223 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Sipa1l1-205ENSMUST00000220963 5907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Serpina3g-201ENSMUST00000043315 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Olfm3-202ENSMUST00000081752 4647 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Cacna1c-206ENSMUST00000185345 6579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm12097-201ENSMUST00000121523 1414 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Scnn1a-206ENSMUST00000176655 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Sardh-202ENSMUST00000102886 4521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Adat1-202ENSMUST00000120457 1677 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Clgn-201ENSMUST00000002259 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Ptk2b-202ENSMUST00000089250 3903 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm23612-201ENSMUST00000103823 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm13026-201ENSMUST00000140113 608 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Cul2-206ENSMUST00000162301 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm4775-201ENSMUST00000169588 402 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm23576-201ENSMUST00000179918 110 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm17936-201ENSMUST00000199413 988 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Fxyd1-214ENSMUST00000206328 545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 CT025603.1-201ENSMUST00000224040 448 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Gm37242-201ENSMUST00000191873 2085 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tyw3-201ENSMUST00000052774 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Slc35c1-201ENSMUST00000067631 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Smarcc2-203ENSMUST00000105235 4032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Taf4E9QAP7 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms