Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Sptb-202ENSMUST00000166101 8084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Rasgrp4-211ENSMUST00000203380 3077 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Usp12Q9D9M2 Phf8-202ENSMUST00000046962 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Lin54-210ENSMUST00000154921 3734 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Trbv31-201ENSMUST00000103300 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Eapp-202ENSMUST00000110713 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm12028-201ENSMUST00000118065 436 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm16209-201ENSMUST00000118457 627 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm10171-201ENSMUST00000126220 628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ighv1-70-201ENSMUST00000196509 351 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC129217.1-201ENSMUST00000225181 642 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm10233-201ENSMUST00000089275 628 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Dusp11-201ENSMUST00000032071 6435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc39a14-210ENSMUST00000152067 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ehmt1-205ENSMUST00000114432 4539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm15886-201ENSMUST00000123155 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tex33-203ENSMUST00000169575 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mir6359-201ENSMUST00000183668 81 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 5033404E19Rik-202ENSMUST00000194748 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7904-201ENSMUST00000217049 465 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cdh1-203ENSMUST00000167688 3203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm32511-202ENSMUST00000217021 2069 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms