Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 9530059O14Rik-204ENSMUST00000215759 1606 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Scgb1b29-201ENSMUST00000108094 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm15285-201ENSMUST00000119271 473 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm13281-201ENSMUST00000120871 567 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm12035-201ENSMUST00000121890 623 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm16252-201ENSMUST00000144420 857 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm20821-202ENSMUST00000180352 684 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Mrgprx3-ps-201ENSMUST00000187741 918 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm38191-201ENSMUST00000194509 770 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm31466-201ENSMUST00000195457 916 ntTSL 3 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm18894-201ENSMUST00000198794 694 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm5905-201ENSMUST00000211731 580 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Fibp-205ENSMUST00000225141 1209 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Olfr1384-201ENSMUST00000060434 1034 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 n-R5s25-201ENSMUST00000082923 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Gm43221-201ENSMUST00000197612 2071 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Q3U6N9 Adh1-201ENSMUST00000004232 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Ttll2-201ENSMUST00000115747 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Itga3-202ENSMUST00000107739 4636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 1810058I24Rik-201ENSMUST00000130875 690 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Tmem242-202ENSMUST00000185896 780 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Cox7a1-202ENSMUST00000208441 485 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Gm36287-201ENSMUST00000223481 796 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Cxcl3-201ENSMUST00000031326 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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Q3U6N9 Gm16982-201ENSMUST00000181275 2620 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 H2-T3-204ENSMUST00000102675 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
Q3U6N9 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
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