Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm25018-201ENSMUST00000179081 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s104-201ENSMUST00000179107 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s113-201ENSMUST00000179143 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s133-201ENSMUST00000179275 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s107-201ENSMUST00000179704 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm26391-201ENSMUST00000179843 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s110-201ENSMUST00000179995 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s128-201ENSMUST00000180096 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 n-R5s124-201ENSMUST00000180334 119 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Psmb6-ps2-201ENSMUST00000187074 705 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm7539-201ENSMUST00000189789 630 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 E230034D01Rik-203ENSMUST00000217357 1159 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm32296-201ENSMUST00000220590 1057 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 CAAA01139602.1-201ENSMUST00000222545 283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC154806.7-201ENSMUST00000227998 202 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cd177-201ENSMUST00000063956 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Celf1-203ENSMUST00000068747 7614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Hcfc1-201ENSMUST00000033761 8138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 AC144938.1-201ENSMUST00000223994 2167 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cntrl-206ENSMUST00000113037 5970 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Napepld-202ENSMUST00000115217 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Exoc5-207ENSMUST00000162175 12699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Csnk2a1-201ENSMUST00000099224 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm29773-201ENSMUST00000212751 1895 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sh3pxd2b-201ENSMUST00000038753 7413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Adcy3-201ENSMUST00000020984 4348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm15604-201ENSMUST00000118350 1456 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nudcd1-201ENSMUST00000038719 2600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Kif2a-206ENSMUST00000159772 2570 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Cpne5-201ENSMUST00000024805 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Adgrl2-208ENSMUST00000197567 5585 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Hivep2-205ENSMUST00000191138 9846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Pde11a-201ENSMUST00000099992 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Wnt5a-202ENSMUST00000112272 3650 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Dnajc10-201ENSMUST00000028392 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Mkrn2os-202ENSMUST00000112957 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm12489-201ENSMUST00000119364 148 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 Thyn1-202ENSMUST00000213683 1107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
PrcdQ00LT2 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms