Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Fgf14-201ENSMUST00000026631 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Eef2k-204ENSMUST00000106489 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cyp2e1-201ENSMUST00000026552 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hinfp-205ENSMUST00000216508 5333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Elavl1-204ENSMUST00000209010 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gria4-201ENSMUST00000027020 5441 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4933413C19Rik-201ENSMUST00000162380 2217 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm37976-201ENSMUST00000193827 345 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC161172.1-201ENSMUST00000227801 486 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Olfr1189-201ENSMUST00000090700 921 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Taar5-201ENSMUST00000092659 1014 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Mlph-201ENSMUST00000027528 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC153498.1-201ENSMUST00000219775 2722 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4631405J19Rik-202ENSMUST00000111270 2909 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Pde4d-202ENSMUST00000079975 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Fam122b-201ENSMUST00000071023 4334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Shcbp1-201ENSMUST00000022945 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hspd1-ps4-201ENSMUST00000121815 1668 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Idua-201ENSMUST00000071650 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Slc35b4-201ENSMUST00000019143 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Trp63-207ENSMUST00000115308 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tnfaip8-212ENSMUST00000179937 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Dock7-201ENSMUST00000030286 7127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Aox2-201ENSMUST00000114366 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Samsn1-201ENSMUST00000114239 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ralgapb-202ENSMUST00000109485 6709 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm26637-201ENSMUST00000180880 2289 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nrxn1-225ENSMUST00000197268 2280 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Hcfc1-202ENSMUST00000114372 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Aqp4-201ENSMUST00000079081 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Klhdc7a-201ENSMUST00000105031 7807 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Ubl5-211ENSMUST00000162303 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm19918-201ENSMUST00000194858 400 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Rsf1-201ENSMUST00000107153 11124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Henmt1-203ENSMUST00000106586 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm28578-203ENSMUST00000189196 1470 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Phf20-201ENSMUST00000037401 5737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp324-201ENSMUST00000038701 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Clec4a3-201ENSMUST00000088468 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
SbdsP70122 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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