Protein–RNA interactions for Protein: P62274

Rps29, 40S ribosomal protein S29, mousemouse

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps29P62274 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ppp4r1-204ENSMUST00000160664 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cadm2-201ENSMUST00000114292 9564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm26527-201ENSMUST00000180416 1948 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700048O20Rik-202ENSMUST00000214777 1900 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700010I14Rik-203ENSMUST00000151609 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ica1l-205ENSMUST00000189776 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm10406-201ENSMUST00000100895 1813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm5099-201ENSMUST00000194892 1848 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ighv6-3-201ENSMUST00000103486 356 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ighv6-6-201ENSMUST00000103489 357 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm25561-201ENSMUST00000104607 125 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm6238-201ENSMUST00000120999 465 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gstm1-202ENSMUST00000126593 828 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm5561-201ENSMUST00000178932 480 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm37016-201ENSMUST00000195507 660 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 D5Ertd605e-201ENSMUST00000201128 1081 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Pf4-203ENSMUST00000202625 411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm45500-201ENSMUST00000211676 803 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm18119-201ENSMUST00000219972 616 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm3926-201ENSMUST00000223378 1123 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ndufc1-201ENSMUST00000038108 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Cd1d2-201ENSMUST00000041920 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tenm2-202ENSMUST00000102801 9908 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Nol8-209ENSMUST00000223467 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Myom2-201ENSMUST00000033842 5075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Tfap2b-204ENSMUST00000187754 3023 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gpatch4-201ENSMUST00000029707 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Rps29P62274 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ephb4-202ENSMUST00000111054 3784 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps29P62274 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Fut8-202ENSMUST00000171770 2765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nod2-201ENSMUST00000054324 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Phc1-215ENSMUST00000161739 3893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm12159-201ENSMUST00000143869 1447 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm43585-201ENSMUST00000199375 1403 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slc7a9-203ENSMUST00000118969 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 N4bp2-201ENSMUST00000087264 5308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Myrf-205ENSMUST00000189897 3339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Gm37484-201ENSMUST00000195378 2523 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Tbl3-202ENSMUST00000126319 5226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Rps29P62274 Bpifb9a-201ENSMUST00000088924 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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