Protein–RNA interactions for Protein: P49813

Tmod1, Tropomodulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tmod1P49813 Pop1-202ENSMUST00000079028 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Cdkl2-202ENSMUST00000086978 4066 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Tmod1P49813 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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Tmod1P49813 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms