Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Iqgap3-204ENSMUST00000194440 3263 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Map4k4-217ENSMUST00000195636 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Zfp1-202ENSMUST00000211926 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Zfp536-206ENSMUST00000176205 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Pik3r3-202ENSMUST00000106490 1830 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Tmem106a-201ENSMUST00000039581 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Vmn1r181-205ENSMUST00000228399 4616 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Csf2rb-201ENSMUST00000096355 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Lipg-201ENSMUST00000066532 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Utp14b-202ENSMUST00000151622 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Pibf1-201ENSMUST00000022650 2797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 4930480K15Rik-201ENSMUST00000162121 2199 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Zfp287-203ENSMUST00000128370 2062 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rab44-201ENSMUST00000087942 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Stk33-205ENSMUST00000141210 949 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm16263-201ENSMUST00000144680 502 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm16033-201ENSMUST00000144915 596 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm27203-201ENSMUST00000183677 307 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm8022-201ENSMUST00000191763 904 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm2253-201ENSMUST00000211775 414 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 AC166165.1-201ENSMUST00000214352 874 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Acsl6-203ENSMUST00000072178 2432 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 A630052C17Rik-201ENSMUST00000129876 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rfx6-202ENSMUST00000122922 3464 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Fbxo34-204ENSMUST00000165714 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rbbp4-201ENSMUST00000102598 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Tmem87a-201ENSMUST00000090042 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 4930429F24Rik-201ENSMUST00000151676 1520 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Aplf-202ENSMUST00000065997 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 AC117245.3-201ENSMUST00000217495 2176 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Arid3b-201ENSMUST00000004780 3785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 D030018L15Rik-203ENSMUST00000140253 2902 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Tgfbi-201ENSMUST00000045173 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm16387-201ENSMUST00000180990 2632 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 AC153524.2-202ENSMUST00000220401 1794 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rsrc1-201ENSMUST00000046542 3062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 AC154176.2-201ENSMUST00000225376 6429 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Dido1-206ENSMUST00000103057 4906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Il1rap-201ENSMUST00000023156 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Dysf-204ENSMUST00000113821 6803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Pi4ka-211ENSMUST00000154364 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Myc-208ENSMUST00000191178 1362 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 L1cam-201ENSMUST00000066576 4116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Hdhd2-201ENSMUST00000026485 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Adora3-201ENSMUST00000000574 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rian-213ENSMUST00000182981 1219 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm19566-201ENSMUST00000199576 610 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 1700012J15Rik-201ENSMUST00000203458 471 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Gm29797-201ENSMUST00000207856 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 1700027J07Rik-202ENSMUST00000215747 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 AI463170-201ENSMUST00000217839 970 ntBASIC9.04□□□□□ -0.96
Cd28P31041 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
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