Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mir705-201ENSMUST00000102058 82 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm44805-201ENSMUST00000127648 765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13393-201ENSMUST00000141935 396 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13660-201ENSMUST00000142828 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ttc39b-206ENSMUST00000148811 727 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Pdc-201ENSMUST00000165062 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm21083-201ENSMUST00000188807 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm40153-201ENSMUST00000197904 637 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm19798-201ENSMUST00000201502 457 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm33016-201ENSMUST00000221224 677 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mir194-2-201ENSMUST00000083648 86 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Olfr169-201ENSMUST00000090062 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm6741-201ENSMUST00000057074 1330 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tmigd1-202ENSMUST00000102495 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC242690.1-202ENSMUST00000214616 1742 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Lrrc4-201ENSMUST00000062304 3615 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Snx10-202ENSMUST00000114439 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm11411-201ENSMUST00000117951 719 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Epp13-201ENSMUST00000121024 957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm11915-201ENSMUST00000153669 358 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm23479-201ENSMUST00000158876 122 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 AC156633.1-201ENSMUST00000215971 614 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm5148-202ENSMUST00000099128 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Gm39464-201ENSMUST00000214091 2169 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
ScaperF8VQ70 Bcl7a-202ENSMUST00000117971 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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