Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN8

Gm5114, MCG1026354, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5114W4VSN8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm5114W4VSN8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm5114W4VSN8 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gm5114W4VSN8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms