Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm3550W4VSN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm3550W4VSN7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms