Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Homer1Q9Z2Y3 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Homer1Q9Z2Y3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Homer1Q9Z2Y3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms