Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Hdac5Q9Z2V6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Hdac5Q9Z2V6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Hdac5Q9Z2V6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms