Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vamp5Q9Z2P8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vamp5Q9Z2P8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms