Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z185

Padi1, Protein-arginine deiminase type-1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi1Q9Z185 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Padi1Q9Z185 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Padi1Q9Z185 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Padi1Q9Z185 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Padi1Q9Z185 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Padi1Q9Z185 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Padi1Q9Z185 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 192.2 ms