Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccl8Q9Z121 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccl8Q9Z121 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms