Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Clip2Q9Z0H8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Clip2Q9Z0H8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Clip2Q9Z0H8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms