Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Gbp2Q9Z0E6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gbp2Q9Z0E6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms